En Fighters Destiny, el jugador controla un personaje poligonal sobre una arena pudiéndose mover en cualquiera de las tres dimensiones del ring. El juego es el típico juego de lucha uno contra uno sin poder utilizar armas; utilizando una gran variedad de puñetazos, patadas, bloqueos, llaves y lanzamientos mientras el jugador intenta abatir a su oponente. Al contrario que otros juegos, en este juego no es primordial acabar con toda la barra de vida del contrincante. Lo más importante es conseguir puntos hasta conseguir todos los necesarios para ganar la partida. Por quitar toda la barra de vida al contrincante y después golpearle, sólo gozamos de unos segundos para golpearle hasta que se recupere (mientras el adversario puede moverse lentamente pero no puede ni atacar ni defenderse), nos dan dos puntos. También, los escenarios tienen límites por lo que tirar a nuestro adversario nos darán un punto ( cabe destacar que, normalmente, antes de caerte del ring te puedes coger del borde y volver a subir o, como nota curiosa, aguantar en el extremo durante unos pocos instantes que podremos utilizar para tirar al adversario si está muy cerca de nosotros, aunque podemos caernos por tardar mucho). Además de los ataques básicos, cada jugador consta de unos movimientos especiales, llamados "moves", que pueden utilizarse durante el combate. Estos simples movimientos nos permitirá agarrar al adversario y realizarle una llave. Tras realizar dicho movimiento, el adversario tiene un tiempo para realizar una acción que puede ser:
Frenar la llave, sin ninguna pérdida de vida.
Realizar un contraataque, por lo que el tiempo para reaccionar disminuye del contrincante( no hay límite para contrarrestar pero llega un momento que es prácticamente imposible debido al tiempo).
No hacer nada, por lo que tras realizar el contrario la llave se gana tres puntos.
También existen unos movimientos especiales, los cuales son muy lentos cuando se realizan, que si le da al adversario, sin haberse defendido, ganaremos cuatro puntos. Además, si el tiempo termina, los jueces adjudican un punto valuando la vida y las acciones.
Fighters Destiny ofrece cinco modos de juego. Está el clásico modo Vs com contra la máquina, pudiendo obtener un nuevo personaje seleccionable (Boro) y aprender nuevas habilidades para su personaje. En el modoVs player se puede luchar contra otro segundo jugador, desafiar nuestras habilidades y ganar nuevos personajes en el modo "Record Attack", jugar en el modo "Mater Challenge" para aumentar la lista de movimientos de nuestro personaje y entrenar contra un personaje robot. Cuando el jugador aprende nuevas habilidades contra la máquina o en el modo Master Challenge, pueden guardar su nueva lista de movimientos en el Controller Pak; más tarde, la nueva lista de movimientos puede ser accedida desde cualquier modo para ayudar al jugador.